Magi - Ứng dụng khám phá gữ liệu gen ung thu

Magi - Ứng dụng khám phá gữ liệu gen ung thu


Ngày nay, công nghệ được cải thiện rất nhiều và có một ứng dụng cho hầu hết mọi thứ như các ứng dụng cho các tin tức, mạng xã hội, ngân hàng, giải trí và như vậy. Bây giờ là tin tức đó, các nhà khoa học của Đại học Brown đã xây dựng một ứng dụng gọi là Magi (Mutation Annotation và Genome Giải thích) sử dụng mà người dùng có thể so sánh kết quả này với nhiều bộ dữ liệu di truyền ung thư.

Về cơ bản, 'Magi' là một ứng dụng mã nguồn tương tác và mở cho phép các bác sĩ và các nhà nghiên cứu để điều tra các dấu vết của ung thư. Sử dụng công cụ này, người dùng có thể tìm kiếm, hình dung và cũng giải thích các bộ dữ liệu di truyền ung thư công cộng bao gồm các dữ liệu từ TCGA (The Atlas Cancer Genome) dự án. Cùng với dữ liệu TGCA, ứng dụng này cũng cho phép bạn upload dữ liệu riêng của bạn và so sánh kết quả với những người trong cơ sở dữ liệu.

Tại sao 'Magi' được phát triển?

Theo Max Leiserson, dẫn đầu phát triển của Magi, ứng dụng cho phép người dùng khám phá gen ung thư dữ liệu bằng cách sử dụng một trình duyệt web thường xuyên ngay cả khi anh / cô ấy không có bất kỳ chuyên môn tính toán. Ông cũng nói rằng gánh nặng tính toán trên các bác sĩ và các nhà nghiên cứu, đã được lý do chính cho sự phát triển của một ứng dụng tuyệt vời như vậy.

Trong mười năm qua, rất nhiều nhà nghiên cứu làm việc trên TCGA đã lập trình tự gen từ về hàng ngàn khối u và các loại ung thư để hiểu được sự đột biến để đóng góp vào sự phát triển của ung thư. Nỗ lực này đằng sau những phân tích động lực thúc đẩy các nhà khoa học của Đại học Brown đã dẫn đến sự phát triển của Magi.

Làm thế nào hữu ích ứng dụng đã được?

Các ứng dụng đã thực sự rất hữu ích cho các bác sĩ và các nhà nghiên cứu trong phòng thí nghiệm. Hôm nay, các trình tự gen đã trở nên nhanh hơn và rẻ hơn cũng; các nhà nghiên cứu đã thực sự bắt đầu sắp xếp trình tự các mẫu dựa trên các nghiên cứu riêng của họ và đôi khi có sự tham khảo một vài khối u. Nhưng bây giờ, họ có thể tải lên các kết quả để MAGI và họ có thể sử dụng bộ dữ liệu công cộng rất lớn để giải thích dữ liệu riêng của họ.
Theo Ben Raphael, Giám đốc Đại học Brown, đột biến rất đa dạng và chúng được lan truyền trên tất cả các gen. Vì vậy, trong bộ gen ung thu, giá trị thực sự nằm trong các kích cỡ mẫu lớn. Ông cũng giải thích rằng, nếu ông đã giải mã trình tự bộ gen của một vài bệnh ung thư từ một ngân hàng khối u địa phương, điều đầu tiên ông sẽ làm là để so sánh dữ liệu của mình với các bộ dữ liệu công cộng rất lớn cho tương đồng. Sản lượng tạo ra bởi MAGI có một vài cách để hình dung các kết quả. Nó cũng cho thấy mức độ thường xuyên một gen bị đột biến trên các mẫu và các thông tin khác.

Như đã nói ở trên, ngày nay việc xác định trình tự gen đã trở nên nhanh hơn để các kỹ thuật viên phòng thí nghiệm và các nhà nghiên cứu có thể sử dụng dữ liệu về gen để chẩn đoán và cũng để phát triển một quá trình điều trị cho nhiều loại ung thư. Các phòng thí nghiệm được thiết kế để làm cho các ứng dụng miễn phí có sẵn để những người đang ở trong gen ung thư cộng đồng có thể sử dụng nó.

Hiện nay các ứng dụng di động đang đóng vai trò quan trọng ngoài các trò chơi và ứng dụng giải trí, như tin tức, các ứng dụng y tế liên quan giúp người sử dụng để biết thêm về các vấn đề sức khỏe.